保定军校是为北洋军培养军事干部的，段祺瑞一向很重视，经常前往巡视，有一次悄悄来到军校，却听许多学员都在抱怨伙食太差，他又去伙房一看，果然差劲之至，米是糙的，面是霉的，菜盆里连一点油星子也见不到。他当时就气得叫来军需主任，让他说清楚。

军需主任嗫嚅不敢言，段祺瑞发了火：“克扣军饷是什么罪，你比我清楚，你大概不想活了。”说着话，一旁站着的卫兵走上前来就要把军需主任架出去。

“这不干我的事。”军需主任大叫，他拉开抽屉，取出账本，“我这里每一笔开支都记得明白，是段大人的那位侄儿手脚不干净。”

待那位侄儿捆到了段祺瑞面前，犹是嘴硬：“我是贪污了不少钱，但许多都用在叔叔家中了。”

知道了实情后，段祺瑞更是大怒，“你小子不安好心，分明以我为挡箭牌，我一生的清誉都被你毁了。来人呀，集合队伍，将这小子打他个五百军棍。”

这五百军棍是什么样的惩罚?一般人几十军棍就得皮开肉绽，很少能挨过上百之数的，段祺瑞已经动了杀机。

幸亏执刑的人棍下留情，就这样，这小子也被打成了终身残废。这还不算，段祺瑞还得惩罚自己任用私人，管教不严，堂堂的陆军部长，当着众人面走进了禁闭室。这个禁闭室是一座铁皮棚子，也就两个平方左右，站不直，躺不下，没有窗户，密不透风，在太阳下一晒，就像蒸笼一般，别说段祺瑞是上了年纪的人了，就是精壮青年，也熬不过。许多人是宁愿打军棍，也不受这份洋罪的。

徐树铮想劝段祺瑞，这件事如此处理就得了，京城里有多少大事要办，段大人不必过于自责，对自己太苛刻了。段祺瑞眼一瞪:“你以为我在演苦肉计?”

整整48个小时，段祺瑞才在别人搀扶下走出禁闭室，只见他面色惨白，人都虚脱了。所以后来袁世凯向他头上泼污水，说他吃回扣，才最让段祺瑞不能忍受：“既然大总统不相信我，我也不赖在这个位置上。”手一甩，挂印而走，从此称病闭门不出，以示与袁不合作之态度。

段祺瑞在家没呆多久，袁世凯就撑不住了，帝制不得人心，蔡锷将军振臂一呼，一场反袁的风暴卷地而起，他的北洋军不可依恃，根本不听调度，无可奈何之下，只得请段祺瑞重新出山，因为段是小站旧人，北洋元老，在军中的关系盘根错节，很多将领是要买他面子的。

听说袁世凯重新启用段祺瑞，徐树铮奋袂而起，大呼:“取江山的机会到了。”他给段祺瑞出了个主意，不妨以蔡锷之护国军压迫洪宪帝制，以倒袁下台为条件，左右其手，乘时而起，取袁而代之。

计是好计，但段祺瑞却连连摆手，他刚从中南海回来。几个月不见，袁世凯憔悴多了，他拉着段祺瑞的手:“悔不当初，没听你的忠告，现在闹成这般光景。唉，外面的事多拜托了。”说罢，不胜凄凉。他了解段祺瑞的脾气，一向是吃软不吃硬，所以装出了可怜相。

段祺瑞果然受不了袁世凯这一套，动了恻隐之心：“袁项城以前对我不薄，我不能乘人之危。”

“量小非君子，无毒不丈夫。不要忘了袁项城乃当代奸雄，宁可我负天下人，不可天下人负我。当初他对你可不心慈手软。”徐树铮咬牙切齿。

纵然如此，他还是狠不下心来：“我毕竟跟随袁项城几十年了，有君臣之义，翁婿之名，袍泽之情，我个人素来讲究旧道德，实在没有这割袍断交、反目为仇的决断。”

所以，在洪宪帝制崩溃的过程中，段祺瑞虽然没有像过去那样为袁世凯充当打手，但也没有墙倒众人推，起兵发难，他只是作壁上观，冷漠地看着袁世凯在万众诅咒中死去。